Helsingin yliopistollinen keskussairaala
Kardiologian klinikka
4.7.2003
Kari Virtanen
kardiologian dosentti, osastonylilääkäri

BayMiner avaa sydänten saloja HYKSin kardiologian klinikalla

HYKSin kardiologian klinikalla on Suomen ainoa puhtaasti isotooppikardiologiaan omistautunut gammakamerayksikkö. Yliopistollisen keskussairaalan tehtäviin kuuluu potilaiden tutkimuksen ja hoidon lisäksi lääketieteellinen tutkimustoiminta ja sen osana tutkimusmenetelmien arviointi ja kehittäminen. HYKSin kardiologian klinikalla on jo vuodesta 1996 lähtien ollut käynnissä tutkimusprojekti, jonka tarkoituksena on talliumperfuusiokuvannusmenetelmän arviointi ja sen käyttötapojen kehitystyö. Tutkimuksen tuloksia aiotaan tarjota julkaistaviksi kardiologian alan kansainvälisissä tieteellisissä sarjoissa.

Laboratoriotutkimusten kalleus ja potilaan hoitoon liittymättömien tutkimusten välttämiseen velvoittava lääkärin etiikka aiheuttavat sen, että käytettävissä oleva datamäärä ei voi olla kovin suuri. Siksi analyysimenetelmään kohdistuu suuria vaatimuksia: sen pitäisi antaa hyödyllisiä tuloksia vähäiselläkin datamäärällä. Klassisen tilastotieteen menetelmät vaativat yleensä suuren määrän dataa antaakseen luotettavia tuloksia. Lisäksi niiden käyttöön liittyy taustaoletuksia, joiden täyttyminen valikoidulla potilasaineistolla tehtävässä tutkimuksessa on hyvin kyseenalaista. Jo varsin varhaisessa vaiheessa kävikin ilmeiseksi, että kehittyneemmille analyysimenetelmille olisi todellinen tarve.

Tutkimusyhteistyön avautuminen Helsingin yliopiston tietojenkäsittelytieteen laitoksella ja nykyään Helsinki Institute for Information Technologyn puitteissa toimivan professori Henry Tirrin ja hänen data-analyysiin erikoistuneen CoSCo-tutkimusryhmänsä kanssa johti heidän kehittämäänsä teknologiaa tuotteistavan BayMiner-data-analyysityökalun käyttöönottoon kardiologisen datamme analyysissä. BayMineria käytettäessä eri menetelmillä kerätty potilasdata saadaan havainnollisesti näkyviin ja sitä voidaan tarkastella monin tavoin yhdenkin analyysi-istunnon aikana.

Lääketieteellinen data on aina erittäin monimutkaisen ja dynaamisen biologisen todellisuuden yksinkertaistava tilannekuva. Kardiologinen havaintoaineistomme on jo mittausmenetelmien luonteen takia monin tavoin suhteellista ja keskinäisriippuvaista, eikä kategorisia päättelysääntöjä ole mahdollista saavuttaa, vaan kyse on parhaimmillaankin vain tilanteen hallinnasta epävarmuuden astetta hahmottamalla ja rajoittamalla. Todennäköisyyslaskentaa etevästi soveltava BayMiner on osoittautunut erityisen käyttökelpoiseksi välineeksi tällaisessa data-analyysin kannalta vaativassa ympäristössä.